Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bbs12Q5SUD9 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms