Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms