Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms