Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp48Q3V0C5 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms