Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms