Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Kdm5aQ3UXZ9 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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