Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Pfdn4Q3UWL8 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pfdn4Q3UWL8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pfdn4Q3UWL8 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pfdn4Q3UWL8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pfdn4Q3UWL8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pfdn4Q3UWL8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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