Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms