Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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