Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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