Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Traf3ip1Q149C2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms