Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

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Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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