Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms