Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms