Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms