Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms