Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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