Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms