Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm5530-201ENSMUST00000117185 985 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Tefm-201ENSMUST00000050207 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm16618-201ENSMUST00000134992 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms