Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms