Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Zfp39Q02525 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms