Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms