Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms