Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms