Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms