Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Bop1P97452 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Bop1P97452 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Bop1P97452 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Bop1P97452 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms