Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 245.5 ms