Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx3P81067 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx3P81067 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx3P81067 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms