Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Pkn1P70268 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Pkn1P70268 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Pkn1P70268 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Pkn1P70268 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Pkn1P70268 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Pkn1P70268 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Pkn1P70268 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Pkn1P70268 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Pkn1P70268 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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