Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab1AP62821 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms