Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp46P62069 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp46P62069 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp46P62069 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms