Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2kP61087 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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