Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P58686 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P58686 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P58686 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P58686 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P58686 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P58686 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P58686 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P58686 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P58686 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P58686 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P58686 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P58686 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P58686 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P58686 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P58686 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P58686 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P58686 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms