Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CartptP56388 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CartptP56388 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CartptP56388 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CartptP56388 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CartptP56388 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms