Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nub1P54729 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nub1P54729 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nub1P54729 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nub1P54729 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms