Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
FmodP50608 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FmodP50608 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
FmodP50608 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
FmodP50608 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
FmodP50608 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
FmodP50608 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
FmodP50608 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
FmodP50608 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
FmodP50608 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
FmodP50608 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
FmodP50608 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
FmodP50608 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
FmodP50608 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
FmodP50608 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
FmodP50608 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
FmodP50608 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
FmodP50608 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
FmodP50608 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
FmodP50608 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
FmodP50608 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
FmodP50608 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
FmodP50608 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms