Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Hoxc13P50207 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Hoxc13P50207 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Hoxc13P50207 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Hoxc13P50207 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Hoxc13P50207 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Hoxc13P50207 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Hoxc13P50207 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Hoxc13P50207 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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