Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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