Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrprbP47758 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms