Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp4P35123 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp4P35123 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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