Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
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RxrgP28705 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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