Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RarbP22605 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RarbP22605 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RarbP22605 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RarbP22605 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RarbP22605 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RarbP22605 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RarbP22605 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RarbP22605 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RarbP22605 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RarbP22605 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RarbP22605 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RarbP22605 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RarbP22605 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RarbP22605 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RarbP22605 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RarbP22605 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RarbP22605 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RarbP22605 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RarbP22605 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RarbP22605 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RarbP22605 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RarbP22605 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RarbP22605 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RarbP22605 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RarbP22605 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
RarbP22605 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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