Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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