Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18529 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18529 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18529 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18529 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18529 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms