Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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PtpraP18052 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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PtpraP18052 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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PtpraP18052 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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PtpraP18052 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpraP18052 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpraP18052 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpraP18052 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms