Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms