Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcnaP17918 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms