Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Spi1P17433 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Spi1P17433 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Spi1P17433 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms