Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms