Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms